新疆生产建设兵团医药有限责任公司（下简称兵团医药公司）于1993年6月18日恢复成立。公司是国家批准的新疆唯一一家中央医药救灾储备承储企业，是全国首批、兵团首家通过国家GSP认证的药品经营企业。2014年12月，公司一次性顺利通过了国家新版GSP认证。
公司注册资本6942万元人民币，其中新疆天源健康产业股份有限公司出资额为3193.32万元，占注册资本的46%；重庆医药（集团）股份有限公司出资额为2360.28万元，占注册资本的34%；新疆绿原国有资产经营集团有限公司出资额为1388.4万元，占注册资本的20%。
作为新疆经营范围最为广泛的医药经营企业之一，公司主要从事包括中西药及麻醉药品、精神药品、医疗用毒性药品、医疗器械等的批发销售，经营品规10000余个。
公司总部现有12个部门，在职员工92人。经营办公场所面积1228㎡，仓储库房面积14000㎡。
2016年11月，国内排名前列、西部最大的大型医药实力型集团——重庆医药（集团）股份有限公司成为公司股东，标志着双方紧密型战略合作伙伴关系的确立和全面、多层次、多角度的深度合作的展开。依托重庆医药在行业运营方面的强大优势和领先地位，双方在新经营理念、新业务模式、供应链管理、企业运营、资本输入、人才培养、信息系统等关键技术方面已实现了良好合作。
公司坚持立足兵团、辐射全疆的市场战略，目前，已与300多家下游客户建立了常年业务往来，并建立良好的合作关系，药品购销业务已覆盖了全兵团十四个师，并在全疆率先成功引入药房托管、药事服务业务合作模式，与兵团医院、二师、六师、八师、九师、十三师等众多兵师医疗机构建立了药事服务合作关系。
借助重庆医药的大力支持，公司不断创新业务模式。2017年4月，与石河子人民医院实现院内医药物流（SPD）项目合作。2018年7月16日，公司首家便民药房建设合作项目——兵团医院便民药房建成运营。今后，公司将在疆内特别是兵团系统医疗机构重点推行医院便民药房和院内医药物流合作项目。目前，兵团医药已基本形成以乌鲁木齐为中心，辐射各地州，基本覆盖全疆的销售和配送服务网络。
近年来，公司经营效益不断向好，主要经营指标持续、快速增长。2014年起，企业坚持走质量效益型发展道路，市场覆盖面和盈利能力不断提升。2017年，公司实现营业额4.3亿元。作为兵团唯一直属的国有医药商业企业，目前公司已发展成为全兵团市场覆盖率最高、最具发展潜力、创新特色凸显、经营管理优秀的医药流通企业，并成为兵团商业系统重点支持发展的医药企业之一。
兵团医药公司正在从药品单一经营企业向为公众和社会提供健康利益管理产品和服务型企业过渡。
